Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CYP27C1-202ENST00000409327 2092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms