Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RTL6Q6ICC9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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