Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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