Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms