Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIP10Q15642 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms