Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms