Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms