Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD4Q13485 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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