Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CLN3Q13286 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CLN3Q13286 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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