Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms