Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms