Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms