Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms