Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms