Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms