Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms