Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms