Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms