Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA1P35221 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA1P35221 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA1P35221 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNA1P35221 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms