Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms