Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC27P30260 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC27P30260 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms