Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP1P29466 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms