Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP11P24347 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MMP11P24347 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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