Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC9A1P19634 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms