Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CREB1P16220 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms