Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms