Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGPSO00116 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGPSO00116 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGPSO00116 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGPSO00116 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGPSO00116 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGPSO00116 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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