Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms