Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms