Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf47A7E2U8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms