Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf170A2RU37 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms