Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD1Q9UP38 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD1Q9UP38 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms