Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms