Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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