Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms