Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ROPN1BQ9BZX4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms