Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORT1Q99523 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORT1Q99523 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORT1Q99523 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms