Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms