Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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