Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM12Q96EX1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms