Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD13Q8WZ19 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290 ms