Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC107Q8WV48 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms