Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms