Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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