Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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