Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms