Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CA9Q16790 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CA9Q16790 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CA9Q16790 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CA9Q16790 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CA9Q16790 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CA9Q16790 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CA9Q16790 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CA9Q16790 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CA9Q16790 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CA9Q16790 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CA9Q16790 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CA9Q16790 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CA9Q16790 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CA9Q16790 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CA9Q16790 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CA9Q16790 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CA9Q16790 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CA9Q16790 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CA9Q16790 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CA9Q16790 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CA9Q16790 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CA9Q16790 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CA9Q16790 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CA9Q16790 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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