Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDKN3Q16667 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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