Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms