Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms